小分子干扰RNA 小干扰RNA

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siRNA（小干扰RNA）、shRNA（短发夹RNA）和RNAi（RNA干扰）是密切相关的概念，指的是细胞利用RNA分子调节基因表达的一种机制。

RNAi是发生在细胞中调节基因表达的一个自然生物过程。

它涉及使用小RNA分子，如siRNAs或microRNAs (miRNAs)，有选择地瞄准并降解携带制造蛋白质指令的特定信使RNA (mRNA)分子。这一过程有效地沉默或减少了目标基因的表达。

siRNA是一种可以在实验室中合成的RNA分子，用于诱导细胞中的RNAi。

它通常是一种双链RNA分子，被设计为与特定mRNA分子互补。一旦siRNA被引入细胞，它就会被细胞机制处理成更小的RNA分子，称为小干扰RNA（siRNA），然后与目标mRNA结合并触发其降解，从而减少目标基因的表达。

shRNA是一个单一的RNA分子，它自身折叠形成一个发夹结构。

像siRNA一样，它可以被设计成与特定的mRNA分子互补。一旦shRNA被引入细胞，它就会被细胞机制处理成类似siRNA的分子，可以与目标mRNA结合并触发其降解，导致目标基因的表达减少

RNAi干扰模式

siRNA和shRNA的主要区别在于其结构和传递方式

siRNA通常从细胞外传递到细胞，shRNA则通常从DNA模板在细胞内表达，该模板通过转染或病毒转导被引入细胞。shRNA被细胞机器转录成发夹状的RNA分子，其中包含目标mRNA的有义和反义链。然后，发夹结构被细胞机器加工成类似siRNA的分子，能与目标mRNA结合并降解。

siRNA通常在短时间内有效，而shRNA可以稳定地整合到细胞的基因组中，允许长期基因敲除。

shRNA作用机制

虽然siRNA是RNAi研究中常用的工具，但还有其他类型的RNA分子也能诱导RNAi，如微RNA（miRNA）和短发夹RNA（shRNAs）。这些分子与siRNA相似，可用于靶向特定mRNA分子并诱导其降解，但它们的结构和作用机制不同。

如何选择：siRNA还是shRNA？

siRNA通常用于短期基因敲除实验，因为它可以直接传递到细胞或组织中，并在相对较短的时间内有效。当目标是同时敲除多个基因时，它也很有用，因为可以设计不同的siRNA来针对不同的基因。

shRNA对长期基因敲除实验很有用，因为它可以稳定地整合到细胞的基因组中，并在较长的时间内表达。当目标是创造稳定的细胞系，减少特定基因的表达，或研究体内基因敲除的效果时，它也很有用。

在传递方面，siRNA可以通过各种方法传递到细胞，包括转染、电穿孔或病毒转导。ShRNA通常通过病毒转导传递，因为这样可以稳定地整合到基因组中。